Il concepimento del Fokker 100 fu piuttosto complicato: in un primo momento, i dirigenti della casa costruttrice olandese puntarono infatti su un velivolo che era in altre parole una versione migliore del Fokker 28 "Fellowship", ma in seguito furono costretti a cambiare idea, spostando le loro energie su un aeroplano piuttosto diverso da quello di partenza. Era l'inizio degli anni Settanta, quando gli ingegneri della Fokker si misero al lavoro sul progetto di un bireattore per il medio e breve raggio. All'epoca, il mercato era favorevole agli aeroplani piuttosto grandi, cosa che spinse gli olandesi a immaginare un modello capace di trasportare un centinaio di passeggeri. Nonostante questo, non si poteva ancora sapere che, appena qualche anno dopo, la tendenza sarebbe cambiata. Ancora all'inizio degli anni Ottanta, quindi, la Fokker era impegnata in modo molto tranquillo, nella progettazione di un velivolo praticamente già superato, denominato Fokker F100.

A partire però dagli anni Settanta, la Fokker aveva tentato, senza successo, di trovare un partner che condividesse le spese di sviluppo del nuovo velivolo: in un primo momento aveva avviato una collaborazione con la McDonnell Douglas, che tuttavia risultò fra le tante americane a non essere interessate a collaborare. Al contrario un aiuto importante arrivò da diverse società europee, tra cui anche Airbus, che si occuparono di progettare e costruire diverse parti del nuovo aeroplano.
Il Fokker F100 si alzò in volo per la prima volta nel novembre del 1986: 2 anni dopo, entrò in servizio per Swissair. Quando poi fu dotato di un nuovo e più potente motore, la casa fabbricante ricevette un ordine di ben 75 unità da American Airlines. Quest'ordine fu come una boccata d'aria per la Fokker, la cui situazione finanziaria era già piuttosto compromessa. Al fine di aumentare la redditività dell'F100, all'inizio degli anni Novanta la Fokker decise di produrne una versione più piccola (l'F70), destinata al crescente mercato regionale e che offriva allo stesso tempo buone prestazioni. Tuttavia, erano entrambi troppo costosi per poter resistere all'alto tasso di competitività del mercato aeronautico ed è così che, nel 1996, la casa costruttrice olandese fondata nel 1912 dovette dichiarare fallimento.